สหกรณ์เครดิตยูเนียนมีสมาชิกเป็นเจ้าของและดำเนินงานโดยสมาชิก คือ สมาชิกจะเป็นผู้เลือกตั้งผู้แทนสมาชิกในที่ประชุมใหญ่สามัญประจำปีขึ้นมา 2 คณะ คือ “คณะกรรมการดำเนินการ” จำนวนไม่เกิน 15 คน เพื่อเข้ามาบริหารงาน และ “คณะผู้ตรวจสอบกิจการ” จำนวนไม่เกิน 5 คน เพื่อเข้ามาตรวจสอบการบริหารงานซึ่งทั้ง 2 คณะ ทำงานในรูปแบบอาสาสมัคร และจะเลือกทุกปี เพื่อผลัดกันทำงานในแต่ละปีโดยมีโครงสร้างในการบริหารงาน ดังนี้
